Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms