Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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