Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD93Q9NPY3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms