Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms