Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LIN28AQ9H9Z2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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