Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5DQ9BY66 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms