Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SNHG12Q9BXW3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms