Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF17Q9BXT8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms