Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB11FIP5Q9BXF6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB11FIP5Q9BXF6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms