Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms