Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RIOK2Q9BVS4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIOK2Q9BVS4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms