Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CHCHD7Q9BUK0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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