Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RSG1Q9BU20 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms