Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLF1Q9BQI6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLF1Q9BQI6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms