Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RBBP8Q99708 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms