Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP88Q99567 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP88Q99567 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms