Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2BQ99453 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms