Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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SAMD8Q96LT4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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SAMD8Q96LT4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SAMD8Q96LT4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SAMD8Q96LT4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SAMD8Q96LT4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SAMD8Q96LT4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SAMD8Q96LT4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SAMD8Q96LT4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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SAMD8Q96LT4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SAMD8Q96LT4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SAMD8Q96LT4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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