Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCARF2Q96GP6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms