Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHF21BQ96EK2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHF21BQ96EK2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms