Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAF2Q96CS3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms