Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCE1Q969G3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms