Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRG4Q92954 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms