Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TOPBP1Q92547 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms