Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSRNP3Q8WYN3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms