Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX3LQ8TDB6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms