Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms