Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPAP2Q8IXW5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms