Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00523Q86TU6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms