Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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