Protein–RNA interactions for Protein: Q70E73

RAPH1, Ras-associated and pleckstrin homology domains-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPH1Q70E73 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAPH1Q70E73 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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