Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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