Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRRC8EQ6NSJ5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms