Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRAMD4Q6IC98 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms