Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms