Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RIF1Q5UIP0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms