Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BRMS1LQ5PSV4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms