Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPANXN3Q5MJ09 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms