Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNT1Q5JUK3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCNT1Q5JUK3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms