Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TDRD12Q587J7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD12Q587J7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms