Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CH25H-201ENST00000371852 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms