Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms