Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TWISTNBQ3B726 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms