Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

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Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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ZNF827Q17R98 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF827Q17R98 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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