Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms