Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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