Protein–RNA interactions for Protein: Q16513

PKN2, Serine/threonine-protein kinase N2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN2Q16513 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKN2Q16513 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms