Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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