Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF2Q15853 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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