Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CDSNQ15517 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CDSNQ15517 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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